TY - JOUR
ID - 10.18307/2018.0215
TI - 微囊藻群体总RNA提取方法的比较
AU - 高胜玲
AU - 黄亚新
AU - 卢亚萍
AU - 施丽梅
AU - 孔繁翔
AU - 张小倩
VL - 30
IS - 2
PB - 科学出版社
SP - 441
EP - 448
PY - 2018/04/15/
JF - 湖泊科学
JA -
UR - http://www.jlakes.org/ch/reader/view_abstract.aspx?file_no=20180215&flag=1
KW - 微囊藻群体;RNA提取;qPCR;多糖
KW - Microcystis colonies;RNA extraction;qPCR;polysaccharide
AB - 微囊藻群体富含多糖类物质是影响微囊藻RNA提取的关键因素.为了获得高质量的微囊藻群体总RNA,对比分析4种针对多糖含量较高的方法——方法1 PGTX-bead法、方法2 CTAB-bead法、方法3 FastRNA® Pro Blue Kit和方法4 RNeasy Mini Kit对微囊藻群体总RNA的提取效果.采用琼脂糖凝胶电泳检测微囊藻群体RNA的完整性,Nanodrop ND1000分光光度计检测RNA纯度及浓度,并采用qPCR检测DNA污染情况.结果表明,4种方法都能从微囊藻群体中提取获得RNA,并在去除DNA后都可以进行RT-PCR等后续实验.方法1 PGTX-bead提取的RNA产量最高,纯度好,DNA污染小,成本低,适合从微囊藻群体中大量提取RNA;方法2 CTAB-bead提取的RNA样品产量也较高,但DNA污染严重,适合需要同时提取DNA和RNA的样本;方法3 FastRNA® Pro Blue Kit和方法4 RNeasy Mini Kit提取的RNA产量都较低,但方法4操作简单,耗时短,所检测目的基因的相对表达量较高,更适合从少量的微囊藻群体中提取总RNA.
ER -