TY - JOUR ID - 10.18307/2018.0215 TI - 微囊藻群体总RNA提取方法的比较 AU - 高胜玲 AU - 黄亚新 AU - 卢亚萍 AU - 施丽梅 AU - 孔繁翔 AU - 张小倩 VL - 30 IS - 2 PB - 科学出版社 SP - 441 EP - 448 PY - 2018/04/15/ JF - 湖泊科学 JA - UR - http://www.jlakes.org/ch/reader/view_abstract.aspx?file_no=20180215&flag=1 KW - 微囊藻群体;RNA提取;qPCR;多糖 KW - Microcystis colonies;RNA extraction;qPCR;polysaccharide AB - 微囊藻群体富含多糖类物质是影响微囊藻RNA提取的关键因素.为了获得高质量的微囊藻群体总RNA,对比分析4种针对多糖含量较高的方法——方法1 PGTX-bead法、方法2 CTAB-bead法、方法3 FastRNA® Pro Blue Kit和方法4 RNeasy Mini Kit对微囊藻群体总RNA的提取效果.采用琼脂糖凝胶电泳检测微囊藻群体RNA的完整性,Nanodrop ND1000分光光度计检测RNA纯度及浓度,并采用qPCR检测DNA污染情况.结果表明,4种方法都能从微囊藻群体中提取获得RNA,并在去除DNA后都可以进行RT-PCR等后续实验.方法1 PGTX-bead提取的RNA产量最高,纯度好,DNA污染小,成本低,适合从微囊藻群体中大量提取RNA;方法2 CTAB-bead提取的RNA样品产量也较高,但DNA污染严重,适合需要同时提取DNA和RNA的样本;方法3 FastRNA® Pro Blue Kit和方法4 RNeasy Mini Kit提取的RNA产量都较低,但方法4操作简单,耗时短,所检测目的基因的相对表达量较高,更适合从少量的微囊藻群体中提取总RNA. ER -