《湖泊科学》(www.jlakes.org; ISSN 1003-5427)创刊于1989年，由中国科学院南京地理与湖泊研究所和中国海洋湖沼学会联合主办，主要报道湖泊（含水库）及其流域在人与自然相互作用下资源、生态、环境变化的最新研究成果，刊载与湖泊科学有关的各学科（如物理学、化 学、生物学、生态学、地质学、地理学等）以及湖泊工程、流域综合管理的理论性或应用性研究论文、简报和综述。
《湖泊科学》 2006起改为双月刊，每 1、3、5、7、9、11月6日由科学出版社出版。
《湖泊科学》已经被国内所有权威数据库（机构）列为核心期刊，并被EI等数10家国际专业数据库收录：
中国科学引文数据库核心期刊(CSCD)
中国科技论文统计源期刊(中国科技核心期刊) (中国科技技术信息研究所，万方数据)
《中文核心期刊要目总览》核心期刊(北京大学图书馆)
中文科技期刊数据库（维普）
《中国学术期刊影响因子年报》统计源期刊(中国知网)
RCCSE中国核心学术期刊(武汉大学中国科学评价研究中心)
中国学术期刊综合评价数据库(中国知网)
“万方数据——数字化期刊群”
中国期刊网、中国学术期刊 (光盘版 )全文收录期刊
中国地理与资源文摘
中国生物学文摘
古生物学文摘
水文水资源文摘
中国学术期刊文摘等。
Aquatic Sciences & Fisheries Abstracts
(1:Biological Sciences and Living Resources,
2: Ocean Technology,Policy and Non-Living Resources,
3: Aquatic Pollution and Environmental Quality);
Bibliography and Index of Geology
BIOSIS Previews
Cambridge Scientific Abstracts
Chemical Abstracts
Current Bibligraphy on Science and Technology (日本科技文献速报)
Current Geographical Publications
Earth, Atmospheric & Aquatic Science Database
EI Compendex
Environmental Engineering Abstracts
Environmental Knowledgebase
GEOBASE
Georef
Meteorological and Geoastrophysical Abstracts
Ocean Abstracts
Pollution Abstracts
ProQuest
Scopus
Sustainability Science Abstracts
VITINI Database (俄罗斯文摘)
Water Resources Abstracts
Zoological Records，etc.
《湖泊科学》不收稿件审理费。符合《湖泊科学》格式规范和要求的论文将送至少3位同行专家审阅，《湖泊科学》编辑委员会将在收稿后2个月内给出修改后发表、修改后再审、大修后建议重投或退稿的处理意见并转达作者。
《湖泊科学》投稿系统已经正式运行，2016年起只接受网站投稿系统投稿。
《湖泊科学》提供创刊以来全部论文免费下载(http://www.jlakes.org)。
《湖泊科学》继 2010,2012-2022年之后，第13次(2023年)荣获“中国百种杰出学术期刊”称号。这是中国科学技术信息研究所根据每年公布中国科技论文与引文数据库收录的中国科技论文统计源期刊的 20 余种科学计量指标评选而得，获奖期刊代表了中国科技期刊的最高学术水平。
根据中国科学技术信息研究所 2023年9月公布的 2022年度中国科技期刊引证报告（核心版） , 《湖泊科学》综合评价总分继续排名水文学、海洋科学类第一；其中， 影响因子为2.988（水文学、海洋科学类第一） ，总被引频次达3878 次（水文学、海洋科学类第一）。
根据最新公布（2023年6月）的Scopus数据库的Citescore显示，《湖泊科学》的Citescore有了长足进步，最新为3.3，比去年（2.6）增加了12.7%。在不同学科领域位置有所不同：在Earth and Planetary Sciences学科，位列60/141; 在Water Science and Technology学科，位列125/248; 在Aquatic Sciences学科，位列109/228。
另外，据 中国科学引文数据库（ CSCD ）2023年10月公布的2022年统计数据，《湖泊科学》的影响因子为2.422，总被引频次3152次。
《湖泊科学》全国各地邮局均可订阅，邮发代号：28-201. 2020年起，定价调为68元/期，全年408元。
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